对运行的控制应包括以下几个方面：
2 对体系要素的更新
ISO14001标准要求建立动态的环境管理体系，对要素的更新就是一个动态的过程。
2.1 环境因素的更新
当ISO14000活动和法律法规发生变化时都要重新识别评价环境因素，将新产生的环境影响减少到 程度。环境是ISO14001环境管理体系的重要因素，也是环境管理体系得以建立的基石。另一方面，在建立EMS时如何人有效、充分地识别、评价环境因素，在实施审核时如何审查ISO14000在这一方面的成效，也是EMS工作中困难的任务之一，因为环境因素的识别与评价会对环境管理体系的有效性产生重大的影响。提出，ISO14001标准并未提供方法来决定重要环境因素，但ISO14000应该为此设立一个评价体系来识别和判定出重要的环境因素。
2.2 目标指标和管理方案的更新
目标指标和管理方案应是动态的，当ISO14000的活动、产品或服务发生变化，所对应的项目有变更时，就应该对目标指标和管理方案进行修正，使之与该项目相适应，保证持续有效。制定的目标指标要合理，符合ISO14000的实际需求；管理方案要具体、详细、切实可行，ISO14000在完成方案的同时就可提高整体的环境效果。目标完成后重新制定中短期的目标指标，确定一套新的方案，对未能实现的目标指标和管理纺按应该查找原因，并不断地进行改进。
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——“9.1.1总则”要求，组织应监视、测量、分析和评价其环境绩效，评价其环境绩效和环境管理体系的有效性。这就需要组织去策划：需要监视和测量的内容；适用时的监视、测量、分析与评价的方法；评价其环境绩效所依据的准则和适当的参数；何时应适时监视和测量；何时应分析和评价监视和测量的结果。这可能涉及重要环境因素的控制、环境绩效、运行控制、目标指标的实施情况、风险和机遇应对措施的有效性等
——“9.1.2合规性评价”要求，组织应评价合规性，需要时采取措施
——“9.2内部审核”要求，组织建立内部审核方案，对体系按照计划的世界间隔实施内审，以提供关于环境管理体系是否符合组织自身环境管理体系的要求以及本标准的要求的息，以及是否得到了有效的实施和保持
——“9.3管理评审”要求，由组织的 管理者主持，按计划的时间间隔评价环境管理体系持续的适宜性、充分性和有效性，并寻求改进的机会
以上四个条款均具有发现问题、有针对性分析原因、采取适当的纠正措施以完成监控的功能。每种监控机制均不能独立存在的，在监控内容方面相互联系和补充，构成组织内部完整的监控体系，确保环境管理体系的持续改进
